Технология CRISPR/Cas9 - последние достижения


04.05.18. CRISPR-модифицированные клетки печени могут избавить больных гемофилией B от пожизненных инъекций



Пациенты с гемофилией вынуждены в течении всей жизни вводить инъекции с факторами свертывания крови. Команда ученых из Salk Institute (США) под руководством Suvasini Ramaswamy (на фото) хочет избавить их от этой неприятной процедуры. Они провели эксперимент, в ходе которого мышам с гемофилией B ввели генно-модифицированные клетки печени, которые производят фактор свертывания крови и очень обрадовались, т.к. им удалось восстановить свертывание крови на целый год. Подобный метод генотерапии использует стартап Spark Therapeutics, но в отличии от технологии Salk Institute, они редактируют клетки печени прямо в живом организме.


2018. CRISPR-поисковик для диагностики болезней



Технология CRISPR известна, как инструмент для генной терапии, но американский стартап Mammoth Biosciences придумал использовать ее для диагностики заболеваний. Они создали молекулу, которая, находя и вырезая любой заданный фрагмент ДНК или РНК - окрашивается в определенный цвет, так что это можно заметить под микроскопом, изучая биоматериал. Создатели называют свое изобретение ДНК-поисковиком (аля Google), который ищет заданную ДНК-фразу. Технология может выявлять как вирусные инфекции типа малярии, так и онкологические заболевания, типа лейкемии. Одним из сооснователей стартапа является Дженифер Даудна - та самая, которая изобрела технологию CRISPR (блондинка на фото).


2017. CRISPR использовали против болезни Хокинга



Боковой амиотрофический склероз (БАС), которым, в частности, болеет Стивен Хокинг - это медленная, но неизлечимая деградация нейронов, которую связывают с мутациями в определенных генах. Дэвид Шаффер и его коллеги из Калифорнийского университета в Беркли придумали использовать технологию редактирования ДНК CRISPR/Cas9 для замены гена SOD1, который у людей ответственен примерно за 20% случаев БАС. Авторы провели эксперименты на мышах, несших мутантный человеческий ген. Для доставки CRISPR/Cas9 в спинной мозг ученые использовали специальным образом модифицированные аденовирусы, которые практически безопасны для людей.  У мышей, прошедших такую экспериментальную терапию, признаки болезни развивались заметно медленнее, и в среднем они жили на месяц дольше – не так мало для положенного этой ГМ-линии 4-месячного срока. Посмертное исследование тканей показало, что в спинном мозге таких животных выжили лишь те двигательные нейроны, в которых произошла успешная замена гена.


2017. CRISPR 2.0 стал точнее в 900 раз



CRISPR-редактирование генов может делать две вещи: исправлять гены и отключать их. Только исправляющая функция работает несколько хуже отключающей. Для исправления вам надо добавить часть ДНК с правильной последовательностью к клеткам и запустить процесс исправления. Это работает только в десятой части клеток, а в клетках мозга не работает вообще. И здесь приходит на помощь открытие Дэвида Лю из Гарвардского университета. Его команда создала инструмент для исправления мутаций, прямо заменяя в ДНК одно азотистое основание на другое. Полученные редакторы оснований ВЕ3 и АВЕ7 меняют основания в половине человеческих клеток, при этом не вызывая практически никаких побочных мутаций.


2017. CRISPR можно использовать для ранней диагностики рака и инфекций



Знаменитая технологии редактирования ДНК CRISPR/Cas9 позволяет находить заданный участок ДНК и вырезать его. А что если использовать эту технологию не для редактирования, а для поиска, и не ДНК, а РНК - подумал один из создателей CRISPR/Cas9 Фен Жанг из института Броуда. И изобрел еще одну технологию с говорящим названием SHERLOCK. Зачем она нужна? Дело в том, что клетки, пораженные вирусом или раковые клетки производят определенные цепочки РНК молекул. Если вы найдете такую молекулу - вы диагностируете заболевание. А Фен Жанг утверждает что белок CRISPR может определить присутствие даже одной-единственной молекулы. И что SHERLOCK (когда появится устройство для анализов) способен выявить, например, вирус Зика в крови или моче пациента всего за несколько часов.


2017. Китайцы повысили точность редактирования человеческих эмбрионов до 50%



Пока в США и Европе ученые договорились не редактировать человеческих эмбрионов (из этических соображений), китайцы делают ощутимый прогресс в этом направлении. В прошлом году они экспериментировали на нежизнеспособных эмбрионах и успешность редактирования была очень низкой - около 2%. Конечно, такой процент не устроил бы никаких родителей. Но в этом году они начали эксперименты на жизнеспособных эмбрионах и точность повысилась аж до 50%. Причем, они уже работают над конкретной задачей - предотвращением генетических болезней. Ученые намеренно дали эмбрионам редкие генетические заболевания, а потом попытались вылечить их с помощью CRISPR.


2017. Суд разрешил патентный спор о правах на CRISPR/Cas9



Технология редактирования ДНК CRISPR/Cas9 считается одним из главных инструментов медицины будущего. Но не менее интересная история происходит за кулисами. Технология была изобретена в 2012 году профессором института Бэркли - Дженифер Даудна совместно с Эммануэль Шарпетье из немецкого института Планка. В 2013 другой исследователь Фен Жанг из института Броуда (связанного с MIT) придумал как использовать эту технологию на живых клетках. Кроме того, он успел быстрее Дженифер получить патент на технологию, хотя подал патент на 8 месяцев позже нее. После этого изобретатели рассорились. Каждый со-основал свой стартап, нацеленный на создание конкретных терапий на базе CRISPR/Cas9: Дженифер - Intellia Therapeutics, Эммануэль - CRISPR Therapeutics, а Фен Жанг - Editas Medicine. ***


2017. Разработаны наночастицы для безопасной доставки CRISPR/Cas9 в клетки



Система редактирования ДНК CRISPR/Cas9 состоит из протеина (который собственно редактирует) и сигнальной РНК (которая помещает его на нужную позицию). Эти штучки работают нормально, но процент успешно-отредактированных клеток все еще остается довольно низким. Причина в том, что доставить протеин и РНК через мембрану клетки в ядро так чтоб они не повредились - довольно сложно. Исследователи из Массачусетского университета Амхерст разработали наночастицы, которые служат в качестве контейнера для CRISPR/Cas9. Они пробивают клеточную мембрану и выпускают груз в цитоплазму клетки. С помощью такой доставки процент успешных редактирований удалось повысить до 30%, что по словам разработчиков - великолепно. Причем, пока они используют технологию только на культивированных в лаборатории клетках, а не в живых организмах.


2016. Китайцы первыми применили технологию CRISPR-Cas9 для лечения человека



Пока американские компании спорят на счет того, кому принадлежать права на революционную технологию редактирования ДНК CRISPR-Cas9 и планируют ее первые клинические испытания, китайцы (из Сычуанского университета) уже умудрились применить эту технологию в реальном кейсе. Они использовали технологию для модификации клеток иммунной системы, взятых у пациента, а затем (когда клетки размножились) ввели их обратно в организм, чтобы те более эффективно боролись с раковыми клетками (рак легких). Напомним, недавно подобную технологию успешно применила и в Великобритании конкурирующая фирма - Cellectis. Но они используют не CRISPR-Cas9, а CAR-T.


2016. Технологию редактирования генома CRISPR/CAS-9 испытают для лечения рака



До сих пор предполагалось, что революционная технология редактирования генома CRISPR/CAS-9 будет впервые испытана на людях в 2017 году (для лечения редкой болезни сетчатки). Однако, вице-президент США Джо Байден (который недавно был назначен главным по борьбе с раком), протолкнул идею более скорого проведения испытания этой технологии для лечения рака (а именно - меланомы, миеломы и саркомы). Финансировать тестирование вызвался тот самый Шон Паркер. Для старта клинических испытаний, которые пройдут в онкологическом центре им. Андерсона (в Техасе), осталось лишь получить разрешение FDA. Во время испытаний у пациентов возьмут имунные Т-клетки, модифицируют их с помощью CRISPR и введут обратно в организм, чтобы они уничтожили опухоль. Напомним, недавно подобную технологию успешно применила в Великобритании конкурирующая фирма - Cellectis.


2016. Новая технология удаляет гены ВИЧ из клеток в живом организме



Исследователи из Темпльского университета (США) под руководством Камела Халили (на фото) впервые успешно вырезали сегмент ДНК, принадлежавший вирусу ВИЧ, из всех клеток в живом организме (мыши) с помощью технологии редактирования генов CRISPR/Cas9. В организмы животных вводили аденовирусный вектор — молекулу, которая содержала в себе необходимые нуклеотидные последовательности, а также гены белка Cas. Через две недели после начала эксперимента оказалось, что сегмент ВИЧ был вырезан из ДНК во всех тканях, в том числе в головном мозге, почках, печени, лёгких, селезёнке и клетках крови. Анализ вирусной РНК показал, что её количество сильно снизилось в клетках лимфоцитов, а также в лимфатических узлах.


2016. Генная терапия останавливает дистрофию мускулов



Сразу три группы американских генетиков заявили о том, что им удалось использовать универсальный генетический редактор CRISPR/Cas9 для того, чтобы вылечить дистрофию мышц (пока у мыши). Дистрофия мышц - это врожденное генетическое заболевание, вызванное повреждением в гене, отвечающей за синтез белка дистрофина. При помощи Фен Чжана (изобретателя CRISPR/Cas9), генетики научились редактировать эти гены. Для доставки препарата был использован модифицированный аденовирус, «боевая часть» которого была заменена на систему CRISPR/Cas и «негативы» заменяемых ей генов. Вирус был введен в кровоток животного. В результате, мускулы начали производить дистрофин и укрепляться, причем это происходило не только в пораженных ногах, но и в сердце и в других частях тела мышей.


2015. Ученые договорились пока не редактировать гены у человеческих эмбионов



В США состоялась крупнейшая конференция, посвященная редактированию генома человека, в которой приняли участие ведущих ученых из Великобритании, США и Китая. И хотя участники единогласно признали перспективность использования генной терапии для лечения генетических заболеваний, они решили пока отказаться от экспериментов по редактированию генов в человеческих эмбрионах. Говорят, это пока слишком опасно. Не только для будущего ребенка (ведь редактирование одних генов может вызвать неизвестные изменения в других), но и для всего человечества (ведь если технология попадет в злые руки - мало ли каких мутантов они могут создать). Напомним, недавно китайский ученый Цзюньцзю Хуан использовал систему редактирования генома CRISPR/Cas9 для удаления опасного гена из ДНК имбрионов, однако метод удачно сработал менее чем в 20 процентах случаев.


2015. Технологию генотерапии CRISPR начнут применять на людях в 2017 году



Катрин Босли, руководитель американской компании Editas (разработавшей знаменитую технологию редактирования ДНК CRISPR-Cas9), заявила, что клинические испытания технологии на людях начнутся в 2017. Для начала компания выбрала редкую болезнь сетчатки Амавроз Лебера, вызывающую врожденную слепоту. Этой болезнью страдают всего лишь 600 человек в США, но именно благодаря этому у Editas будет больше шансов получить сертификацию FDA. Кроме того, сетчатка глаза - одно из наиболее удобных мест для использования генотерапии, т.к. нет проблем с доставкой лекарства (медики умеют делать инъекции прямо в сетчатку). Потенциально же, CRISPR может использоваться для лечения любых генетических болезней. Эта технология позволяет с высокой точностью заменить нужный отрезок ДНК прямо в клетках живого организма.


2015. Видео: как происходит редактирование ДНК методом CRISPR



Открытие технологии CRISPR (в 2013 году) называют лучшим, что случилось в медицине за последние несколько лет. Эта технология позволяет редактировать ДНК отдельных клеток, а теоретически и всех нужных клеток в живом организме. В будущем это позволит целиком удалять из генома взрослого человека дефектные гены - например, вызывающие рак или диабет. Или можно будет отредактировать клетку эмбриона для рождения максимально здорового ребенка нужного пола. Данное захватывающее видео показывает, как именно работает технология CRISPR. Если коротко, CRISPR использует естественную реакцию (иммунитет) клетки на появление чужеродного вируса. Чтобы научиться бороться с вирусом (запомнить его), клетка вырезает часть его ДНК и вставляет в свою ДНК. Таким образом, создавая и запуская в клетку правильный вирус, можно перепрограммировать ее геном.


2013. Американские стартапы разрабатывают технологии генной терапии



Если журнал Science назвал главным прорывом 2013 года в научной медицине иммунотерапию рака, то другой (не менее авторитетный журнал) Nature особо отметил технологию редактирования генома в живых клетках при помощи системы CRISPR, разработанную американским стартапом Editas Medicine. Конечно, генотерапия - круче иммунотерапии, потому что иммунотерапия борется с самим заболеванием, а генотерапия - с его источником - с ошибкой в ДНК. Так вот, новая технология CRISPR якобы позволяет намного дешевле и точнее доставлять редактор ДНК в нужные клетки и надежнее обрезать лишние (вредные) отрезки ДНК, чем существующая технология, использующая вирусы. В первую очередь Editas Medicine планирует использоваться свое генетическое лекарство для лечения нейропсихиатрических расстройств, таких как болезнь Хантингтона и шизофрения. Стартап привлек уже $43 млн инвестиций - а такие деньги на ветер не бросают. ***