Анализ микробиома человека для диагностики

Обновлено: 27.05.2018 | Автор: Андрей Миронов, MD
Микробиом - это совокупность микроорганизмов (бактерий, вирусов, грибов и архебактерий), живущих внутри человека и на поверхности его кожи. Анализ микробиома позволяет диагностировать заболевания и прогнозировать их появление.

2017. Viome анализирует микробиом с помощью нейросети


Одной из первых задач нейросетей в медицине был анализ генома. Теперь же машинное обучение хотят использовать и для поиска паттернов в микробиоме человека. Первым это додумался сделать стартап Viome. Как и другие подобные сервисы для анализа микробиома, он присылает клиентам набор для взятия анализа крови. Клиенты отправляют свои анализы обратно в лабораторию Viome. Результаты анализа скармливают нейросети, которая сравнивает их с результатами других пациентов и выдает, какие именно микробы живут в организме данного человека и какие проблемы с пищеварением есть сейчас или появятся в будущем. Потом для клиента составляется список рекомендаций по питанию, которые помогут этих проблем избежать.


2016. Атлас создает сервис анализа микробиома


Российская биомедицинская компания Атлас уже предоставляет онлайн сервис анализа ДНК - альтернативу известного западного сервиса 23andMe. Теперь они создают еще и сервис анализа микробиома - OhmyGut - альтернативу западному uBiome, о котором мы тоже рассказывали. Напомним, микробиом - это экосистема бактерий нашего организма. Сервис будет работать следующим образом: после оплаты вам пришлют по почте контейнер для сбора биоматериала (слюны), вы отправляете образец обратно и получаете в своем онлайн-кабинете состав своего микробиома и набор рекомендаций по правильному питанию. Через 2 недели (после изменения тактики питания) - вы отправляете новый образец и смотрите, как улучшилась ваша внутренняя фауна.


2015. Human Longevity - диагностический центр 2.0


Недавно мы рассказывали о компании Theranos, которая пытается совершить революцию в сфере медицинских лабораторий, благодаря возможности проводить множество тестов по одной капле крови. А вот другая американская компания - Human Longevity - хочет создать сеть диагностических центров, в которых будут использованы последние достижения технологий: комбинация МРТ, стандартных анализов с анализом ДНК и микробиома. Цель Human Longevity - диагностировать болезни, связанные со старением (рак, сердечно-сосудистые, нейродегенеративные...) еще до того, как они возникают. По результатам обследования для пациента составляется план на несколько десятков лет - чем он может заболеть, какие параметры работы организма нужно контролировать и какие превентивные меры следует предпринимать чтобы избежать болезни и продлить жизнь. По данным Human Longevity - на сегодняшний день они являются лидером в мире по количеству секвентированных геномов. Именно огромная база геномов (привязанная к историям болезни) позволяет компании прогнозировать болезни по анализу ДНК.


2015. uBiome - сервис для анализа ваших микробов


Человек представляет собой ходячую экосистему - в человеческом организме обитает множество самых разных микроорганизмов. Более того, количество этих микробов превышает количество клеток примерно в 10 раз. Поэтому, информация о составе и состоянии микробиома конкретного человека является очень важной для его правильной диагностики, лечения, и вообще для выбора правильного стиля жизни. Американский стартап uBiome предоставляет сервис персонального анализа микробиома. За $89 они присылают вам набор для отбора проб (изо рта, носа, кишечника). Вы наносите свой образец кисточкой и отправляете набор обратно, а также заполняете анкету о состоянии своего здоровья. После того, как ваш образец будет исследован, вы получите результаты и логин для входа на сайт, где можно будет увидеть данные в виде рисунков и диаграмм, сравнить свой микробиом с другими людьми, увидеть, что у вас общего - болезни, возраст, стиль жизни и т.д.


2012. Human Microbiome Project исследовал Микробиом человека


Вы думали, мы полностью расшифруем геном человека, и поймем как устроен и работает организм, почему он стареет и болеет и как это лечить? Не тут-то было! Оказывается, что человеческий организм - это не просто куча клеток с одинаковым ДНК. Это еще и (еще большая) куча микроорганизмов, у каждого из которых есть свой геном (эта куча называется Микробиом). Поэтому вслед за проектом Human Genome Project, завершенным в 2003 году, международные научные организации запустили в 2008 еще более масштабный проект Human Microbiome Project, целью которого является расшифровать хотя-бы 900 геномов человеческих микробов. В него было вложено много времени, умов и 173 миллиона долларов. И вот, на днях этот проект опубликовал первые результаты. Оказалось, в теле здорового человека живет более 10000 видов микробов. Причем общее количество микробов в 10 раз превышает количество собственных клеток организма. Микробы живут везде, но в основном - в кишечнике, полости рта, дыхательных путях, на коже и в мочеполовой системе. Они играют важную роль в поддержании иммунитета, обмена веществ, пищеварения и других функций.